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北京市肛肠医院（北京市二龙路医院）是全国最大的以诊治各种复杂、疑难和重症肛肠疾病为特色的三级甲等中西医结合医院。医院创立于1937年，总建筑面积4.2万平方米，开放床位400张，开设18个临床科室，14个医技科室，年门诊量70万，手术量13000余例次。21种拥有自主知识产权特色品牌自制剂临床应用50余年，服务患者近千万人次。

医院1981年迁址西城区下岗胡同。2005年内设德胜社区卫生服务中心。2012年迁至西城区德外大街16号。同年注册5A级民非组织北京市肛肠疾病研究院，经北京市药监局GMP认证特色制剂生产研发中心。2014年评为三级甲等中西医结合医院。2015年组建跨域专科医联体和紧密型医联体。2019年获批药物临床实验机构（GCP）认证。2020年获批医保互联网诊疗资质。

医院肛肠诊疗核心技术位于国内国际领先水平。2019年开展结直肠肛门外科手术12221例，结直肠肿瘤手术160例。在肿瘤、炎性肠病、失禁、便秘、重症感染等疑难重症疾病诊治上，开展经肛门全直肠系膜切除手术（TaTEM）、经自然腔道取标本手术（NOSES），在国内率先开展视频辅助肛瘘治疗（VAAFT），开展粪菌移植对炎性肠病的治疗，腹腔镜下盆底修复重建，骶神经调控治疗大便失禁，不断进行肛肠诊治的国际国内最新实践。

消化内镜下手术2019年26922例，息肉检出9056例次/年，结直肠癌检出500余例次/年。设有PCR实验室，开展结直肠癌前筛查（spting9），人乳头瘤病毒基因检测（HPV），结直肠癌肿瘤基因检测（BRAF)。结直肠肛门特色超声平均诊断35000人次/年，开展超声引导下经直肠穿刺活检等技术，筛查肛管直肠良恶性病变。

医院是北京中医（中西医结合）肛肠医学中心、京津冀大肠肛门疑难病会诊中心、专科医联体牵头单位、北京中医药大学教学医院、北京中医药大学中医学院临床中药基地，中国人民大学医改研究中心教学基地、北京中西医结合学会肛肠分会主委单位、全国肛肠疾病新技术推广单位。